O prefeito de São Paulo, Ricardo Nunes (MDB), já anunciou nove secretários para seu futuro governo, mas ainda não definiu quem ocupará a Secretaria da Educação. A pasta, que possui o maior orçamento do governo, atualmente é comandada por Fernando Padula, indicado por Bruno Covas em 2021. Durante a gestão de Padula, alguns indicadores de qualidade da rede municipal de ensino apresentaram piora. Por exemplo, o Índice de Desenvolvimento da Educação Básica (Ideb) para os anos iniciais do ensino fundamental ficou abaixo do período pré-pandemia em São Paulo.
Em 2019, a cidade recebeu nota 6 no Ideb para os anos iniciais do ensino fundamental. Porém, em 2023, a nota caiu para 5,6, pior do que a registrada em 2021, durante a pandemia, que foi de 5,7. Nos anos finais do fundamental, o indicador voltou ao mesmo patamar de 2019, marcando 4,8. Da mesma forma, a nota foi menor do que a registrada em 2021, quando a cidade obteve 5,1.
Além disso, a alfabetização dos estudantes também foi um desafio em São Paulo. Uma pesquisa do Ministério da Educação divulgada em julho deste ano indicou que apenas 37,9% dos alunos foram alfabetizados até o 2º ano do ensino fundamental na cidade.
Os problemas na rede municipal de ensino foram utilizados como críticas contra Nunes durante as eleições municipais. A ativista Tabata Amaral questionou o prefeito em debates sobre o desempenho ruim da pasta.