O governo liderado por Tarcísio tomou uma medida drástica ao afastar as funções do delegado da Polícia Civil de São Paulo, Alberto Pereira Matheus Júnior, sob a acusação de colaborar com as atividades do Primeiro Comando da Capital (PCC). Mesmo após o afastamento, o delegado continuará recebendo seu salário mensal de R$ 30,2 mil, mesmo estando denunciado pelo Ministério Público de São Paulo por corrupção passiva, peculato e lavagem de dinheiro.
Alberto Júnior atuava na seccional de São José dos Campos (SP) e foi denunciado no mês de outubro por Vinícius Gritzbach, que era um informante do PCC, em uma declaração feita à Corregedoria da Polícia Civil. Surpreendentemente, o empresário foi vítima de um assassinato com 10 tiros de fuzil em novembro, no Aeroporto Internacional de Guarulhos, na região metropolitana de São Paulo.
De acordo com a denúncia apresentada pelo MPSP, Alberto Junior mantinha relações com o também delegado Fábio Baena e com o chefe de investigações Eduardo Lopes Monteiro. Ambos estão sob custódia, acusados de envolvimento na morte de Gritzbach.
Com a decisão de afastamento, autorizada pelo delegado-geral da Polícia Civil, Arthur Dian, Tarcísio de Freitas atendeu à determinação do Tribunal de Justiça de São Paulo, que restringiu a presença de Alberto Júnior em delegacias e instalações policiais, permitindo-o somente enquanto estiver sendo investigado, e proibindo qualquer tipo de contato com outros suspeitos no caso.
Em sua trajetória, o delegado participou de operações cruciais contra o PCC, como a prisão de Marco Willians Herbas Camacho, o Marcola, em 1999, e a investigação e indiciamento dos líderes da organização por associação criminosa em 2000. Em 2015, Alberto Júnior integrou uma operação que resultou na detenção de 11 importantes membros do PCC em diversas regiões do estado de São Paulo.