IA torna edição genética mais precisa e reduz erros em até 83%, diz estudo

Palavras-chave: IA, edição genética, ContactSeek, AlphaFold3, CRISPR, edição fora do alvo, DNA, RNA guia, adenina, Cas12a

Meta descrição: IA orientada por AlphaFold3 apresenta ContactSeek para aprimorar a precisão de editores genéticos, reduzindo edições fora do alvo em testes com editores de adenina e Cas12a; estudo publicado na Nature.

Um estudo publicado na revista Nature apresenta o ContactSeek, uma plataforma baseada em inteligência artificial desenvolvida para aumentar a especificidade de editores genéticos. A ferramenta utiliza o AlphaFold3 para prever a interação entre as proteínas editoras e os alvos genômicos, com o objetivo de reduzir alterações não intencionais no DNA durante a edição.

Cientistas da China desenvolveram o ContactSeek para comparar as probabilidades de contato entre aminoácidos da proteína editor e as sequências de DNA-alvo e RNA-guia. Ao identificar as partes do editor que contribuem para alterações indesejadas, a plataforma busca orientar ajustes na estrutura do editor para evitar modificações fora do alvo, uma limitação histórica da edição gênica.

“O ContactSeek representa uma abordagem computacional para aprimorar a especificidade de editores gênomicos”, afirmaram os pesquisadores. “A probabilidade de contato é um resultado mais sensível do que a estrutura 3D prevista para distinguir interações diferenciais.”

Em um conjunto de testes, a equipe avaliou o ContactSeek em um editor de base de adenina, ferramenta usada para corrigir uma única letra no DNA. A IA identificou os pontos que geravam alterações indesejadas e sugeriu pequenas mudanças na estrutura do editor. A versão aprimorada, segundo os pesquisadores, reduziu aproximadamente 83% as edições fora do alvo em todo o genoma para um dos RNAs-guia avaliados.

A plataforma também foi aplicada para aumentar a precisão de outro tipo de editor genético: um editor de base de citosina baseado na enzima Cas12a. Apesar dos resultados promissores, os autores destacam que o ContactSeek ainda não está pronto para uso clínico. Novos testes em diferentes tipos de células e alvos genômicos são necessários antes de qualquer aplicação terapêutica.

Os pesquisadores também ressaltaram o potencial de uso futuro da tecnologia. “Antecipamos que o ContactSeek… será amplamente aplicável a uma vasta gama de ferramentas de edição de DNA e RNA”, afirmaram.